El programa Jovenes Rurales inicia en el año 2003, con una cobertura de 168 municipios del Pais. Fue el primer paso del SENA para llegar con formacion a aquellos municipios del País donde la presencia del Estado era precaria en algunas regiones por las dificultades de orden publico, utilizando este programa como estrategia atención a esta población.
Para el año 2009, con la experiencia y las lecciones aprendidas durante su desarrollo y gestión, con el apoyo y la participación de los centros de formación del SENA, se ha renovado el programa desde su mismo nombre, el cual se denominará Jovenes Rurales Emprendedores.